Насчет длинных имен: я видел статью, посвященную ведению архива с 8-символьными числовыми именами объектов хранения. Мне такое не нравится - сложно больно. Необходимость переименования возникает как только в архив попадают фотографии с нескольких камер.

Какой софт понимает тэги и что ты подразумеваешь под "понимает"?

Обработаные фотки ты предполагаешь хранить в том же дереве или в отдельном? Опять же что с фотоальбомами?

Насчет буферной папки - подробнее.